富含锰矿物的沉积岩称为锰质岩，当锰含量达到工业品位时即构成锰矿石。含锰的矿物主要有锰的氧化物及氢氧化物、碳酸盐、磷酸盐和锰的硫化物等。软锰矿常呈鲕状或土块状集合体；硬锰矿呈葡萄状、鲕状或细晶集合体；水锰矿则呈鲕状或致密块状产出。菱锰矿主要呈结晶粒状或鲕状出现。锰方硼石是无水氯硼酸矿物，一股呈细粒集合体，具假鲕构造。
海相沉积锰质岩：分布于古陆边缘的浅海近岸地带，矿层位于沉积间断面上的海侵层序的底部。矿体呈层状或透镜状，层位稳定。世界上一些大型锰矿，如苏联尼柯波尔第三纪锰矿床，澳大利亚葛罗特白垩纪锰矿床均属此类。我国此类矿床的已知成矿时代有前震旦纪、震旦纪、奥陶纪、泥盆纪、二叠纪和三叠纪。
湖相沉积锰质岩可构成小型矿床，主要产于第四纪地层中，成因与热泉有关。
现代海洋沉积铁锰结核：铁、锰结核在太平洋、大西洋、印度洋洋底有广泛分布。呈球状、半球状、饼状或不规则状，由核心和含矿包壳组成。核心的成分经常是熔岩和火山碎屑岩，结核的包壳呈同心圆状构造，主要由铁锰氧化物组成。来自洋底的铁锰结核，一般呈土黑色。在铁锰结核中还含有可综合利用的Cu、 Co、Ni、V等元素，因而有很大的经济意义。